หลังจากที่เอาชนะอัศวินอมตะได้ "เบ็น" "เกว็น" และ "เควิน" ก็มุ่งหน้าตามเบาะแสไปยังทะเลทราย ที่นั่นพวกเขาพบกับฐานลับของพวกไฮบรดและดีเอ็นเอเลี่ยน รวมถึงแผนการร้ายที่จะทำลายล้างโลก งานนี้ซุปเปอร์ฮีโร่วันรุ่นทั้งสามคนต้องร่วมมือกันหยุดยั้งเอเลี่ยนวายร้าย พร้อมทั้งตามหาตัวปู่แมกซ์ให้เจอ ก่อนที่ทุกอย่างจะสายเกินไป...