เมื่อฮีโร่คืนสนาม 5 ปีผ่านไปหลังจากที่เบ็น เท็นนีสัน ถอดออมนิทริกซ์ออกพร้อมก้าวเข้าสู้ชีวิตเด็กหนุ่มธรรมดาๆ คนหนึ่งแต่แล้วชีวิตปกติต้องสะดุดอีกครั้ง เมื่อเบ็นเท็นถูกเอเลี่ยนวายร้ายลอบโจมตี เด็กหนุ่มก้รับรู้ว่าปู่แมกซ์หายตัวไป เพื่อตามหาปู่แมกซ์ เบ็นต้องขอความช่วนเหลือจาก เกว็น ลูกพี่ลูกน้องคนสนิท มาจิสเตอร์ ว่าที่พนักงานช่างประปาและเควิน อดีตคู่ปรับตัวร้าย ศึกครั้งนี้พวกเขารับมือกับศัตรูใหม่คือ อัศวินอมตะ องค์กรลักลอบค้าวิทยากรต่างดาวและดีเอ็นเอเลี่ยน เอเลี่ยนพันทางสุดชั่วร้าย เมื่อเหล่าวายร้ายเริ่มรุกรานโลก เบ็นจึงขอสวมออกนิทริกซ์คืนสู่สนามฮีโร่อีกครั้ง พร้อมด้วยฮีโร่เอเลี่ยนใหม่ทั้งสิบตัว...